FormaPure XL Totalは、SPRI磁性ビーズによるFFPE(Formalin Fixed Paraffin Embedded:ホルマリン固定パラフィン包埋)組織からのDNA/RNA抽出キットです。FormaPure XL Totalは、Lysis工程の改良により10 μm切片7枚まで抽出することが可能です。Biomekシリーズで抽出自動化することもでき、試薬キットと自動分注機をベックマン・コールター製品に揃えることにより、より充実した技術サポートを受けることもできます。

※ DNAのみ抽出用のForma Pure XL DNA、RNAのみ抽出用のFormaPure XL RNAも用意しております。
※ パラフィン非包埋ホルマリン固定(FF)サンプルからのDNA抽出にも対応しています。詳しくは下部のアプリケーションノートの項をご参照下さい。

Agencourt FormaPure Total

特長

  • 高完全性:他社製品より分解の少ないRNA
  • 高品質:次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA
  • 高収量:同一サンプルからDNAとRNAの両方を収量よく抽出
  • 簡便な実験:SPRI磁性ビーズによるDNA/RNA抽出ワークフロー
  • 自動化:Biomekでの自動化に完全対応

高完全性:他社製品より分解の少ないRNA

Figure 1. 各がん組織由来のFFPEから抽出したRNAの完全性(RNAの分解程度)比較
FormaPure XL Total、他社カラム式抽出キットを使用して、乳がん、大腸がん、肝細胞がん、肺がん由来の10 μm FFPE組織切片各1枚からRNA抽出を行いました。RNAの完全性の評価には、Fragment Analyzer (Advanced Analytical) を使用しました。各がん組織からFormaPure XL Totalで抽出したRNA(青色)は、他社カラム式抽出キット(オレンジ色)よりフラグメントサイズが大きく、分解の少ないRNAの抽出が可能であることを示します。DV200の値は、200 ntを超えるRNA量のパーセンテージを示します。

高品質:次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA


Table 1. FormaPure XL Totalで抽出したDNAで次世代シーケンスを行った際の、低頻度バリアントの検出例
FormaPure XL Totalで抽出したDNAをサンプルとして次世代シーケンス解析を行った結果、低頻度バリアント(変異)も安定して検出可能であることがわかります。FormaPure XL Totalは、FFPE組織からのDNA抽出時にバイアスがかかりづらい特徴があり、次世代シーケンスのDNAサンプル調製に適していることを示します。

高収量:同一サンプルからDNAとRNAの両方を収量よく抽出

Table 2. さまざまな保存年数およびがん由来の10 μm FFPE組織切片各1枚あたりの核酸収量
核酸定量は、それぞれPicoGreen (DNA), RiboGreen (RNA) 蛍光測定により行いました。FormaPure XL Totalは、乳がん、大腸がん、肝細胞がん、肺がん由来の長期保存FFPE組織からでも、高収量でDNAとRNAを抽出可能であることを示します。

簡便な実験:SPRI磁性ビーズによるDNA/RNA抽出ワークフロー

Figure 2. FormaPure XL TotalのDNA/RNA抽出ワークフロー
1. 80℃で脱パラフィン
2. 55℃で組織溶解/脱クロスリンク
3. RNA抽出用サンプルの取り出し
4. 核酸の磁性ビーズへの結合
5. 80%エタノール洗浄
6. DNase I 処理
7. RNAの磁性ビーズへの再結合
8. 80%エタノール洗浄
9. 精製RNAの溶出
10. 80℃で追加の脱クロスリンク
11. DNA抽出用サンプルの取り出し
12. RNase A 処理
13. DNAの磁性ビーズへの結合
14. Washでの洗浄
15. 80%エタノール洗浄
16. 精製DNAの溶出

自動化:Biomekでの自動化に完全対応

  

Table 3. FormaPure XL Totalの手動抽出とBiomek i-Series自動抽出との実験時間の比較
FormaPure XL Totalは、自動分注機Biomek i-Seriesでの自動抽出に最適化されています。NR:推奨しない実験パターン

導入事例

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仕様

内容構成

  • Mineral Oil
  • Lysis LBD (FormaPure XL Totalの場合)
  • Lysis LBA (FormaPure Totalの場合) 
  • Bind BBA
  • Wash WBA
  • Re-Bind RBA
  • RNase A
  • Proteinase K

マニュアル・SDSなど

アプリケーションノート

Order Information

製品名 サイズ 製品番号 価格(税別)
Agencourt FormaPure XL Total
(10 μm FFPE組織切片7枚までの抽出に対応)
50 Preps C35991 ¥85,000
96 Preps C35992 ¥134,000
Agencourt FormaPure Total
(10 μm FFPE組織切片3枚までの抽出に対応)
50 Preps C16675 ¥85,000
96 Preps C16676 ¥134,400

マグネットアクセサリ

使用時に必要です。

関連情報